روغن دانه شاهدانه بالای ۸۰ درصد اسید چرب چند غیر اشباع دارد و یک منبع غنی استثنایی از دو اسید چرب لینولئیک اسید (LA) و آلفا لینولنیک اسید (ALA) است. نسبت امگا ۶ به امگا ۳ در روغن دانه شاهدانه معمولا بین ۲:۱ و ۳:۱ است که برای سلامتی انسان یک مقدار بهینه در نظر گرفته شده است. مصرف اسیدهای چرب امگا ۳ از طریق متابولیت های ایکوزانوئید می تواند به کاهش فشار خون و کلسترول خون منجر شود و همچنین به نرمال کردن متابولیسم چربی در بدن کمک می کند. اسید لینولئیک موجود در شاهدانه با اثرات مهاری بر سمیت سلولی Ab42 و جذب کلسترول کاندید بالقوه ای برای درمان بیماری آلزایمر و بیماری های قلبی عروقی می باشد.
